自然保護區昆蟲有15目88科579屬815種。舜皇山復雜多樣的地形地勢、溫濕多雨的氣候條件和豐富多彩的森林植物群落，均為昆蟲的繁殖、生存創造了良好的環境條件。從地理位置看，舜皇山的昆蟲應屬典型的東洋區系，但由于境內地形復雜，且海拔相對高差較大，在海拔較高的山地部分也還保留有少量的北方種類。