湖南舜皇山自然保護區優越的水熱條件，茂密的森林生態環境，為大型真菌的生長繁殖提供了適宜的場所。據考察自然保護區內共有大型真菌203種，隸屬于20目41科96屬，其中全國新記錄1種，湖南新記錄77種。在這些形形色色的大型真菌中，有57種具食用價值，38種有藥用價值，24種與不同樹木形成外生菌根，105種木材致腐菌，19種有毒菌類。它們與森林植物、動物一道形成了多樣的森林生態系統，它們分解森林中的凋謝物，為許多昆蟲動物提供食源，是森林生態系統中物質循環不可缺少的一個類群，在食用菌與藥用菌及有毒菌體中所蘊含的豐富基因，是人類生存不可或缺的基因庫。